公元1769年3月份，嘉木样二世为请求密多罗灌顶的教法并向章嘉活佛请教5次第的教诫和朝礼五台山，向拉卜楞寺僧众宣布要前往东方，4月22日离开拉卜楞寺向五台山进发。大师在白马寺（青海平安县）停留两天后，到华锐大通河东岸连城鲁土司衙门附近的妙因寺（亦称“大通寺”）受到僧众的欢迎献礼，他给僧众传授了无上瑜伽等教法，并为7名僧人授了比丘戒，当地鲁土司也给大师献了丰厚的布施礼品。此后，渡大通河经庄浪到达华锐松山达隆寺，达隆寺僧众设灶郊迎并献礼，华锐石门寺、华藏寺等的许多僧侣和广大民众聚集在此等候，嘉木样二世为僧众讲经传法，摩顶赐福。公元1771年11月份，乘黄河结冰之际大师东行返回，途经达隆寺又受到僧侣信徒的欢迎，大师前往该寺供斋僧茶，发放布施，讲经传法。这次东行不但达到了他求法的愿望，扩大了拉卜楞寺在许多地区的影响，增强了拉卜楞寺与各个地区的宗教文化和经济关系，而且大大提高了大师个人的地位和信誉.

时隔两年多后，即公元1774年，大师应根卓诺门罕·罗桑土丹嘉措之邀于6月3日抵达华锐石门寺弘法，至7月中旬期间，给加多·莫兰木龙珠、赛促·阿旺慈诚喇嘛等僧俗两千多人传授了金鬘与密乘事部相结合的全部灌顶，给一百五十多名僧人授居士戒，并传授了修念宝生佛、洛扎耳传的随许。大师还特意为石门寺撰写了《菩萨地道安立论》，新修了密学院。并为之制定了寺规，委任瓦日·东珠扎西为喇嘛。东珠扎西在这座密宗院讲经传法，一切行为都超群绝伦，他高兴地说：“我们这里有如此严格的合乎标准的密学院，全是嘉木样雅巴尊者的大恩大德……”。嘉木样二世在石门寺弘法期间，华锐·罗哲、华夏尔·阿旺彭措、桑杰诚勒、彭措云丹等僧人做了随从，在嘉木样二世的鼓励支持下，他们几人赴拉卜楞寺讲经院学习，是同一个学级的学僧，都取得了格西学位。

元初萨迦班知达一行到过华锐嘎达寺，当时该寺还未建成，彼师将此地与五台山比美，并亲自在此处初次修建了萨迦派静修院。明时，萨迦振的曲吉坚赞和格鲁派的高僧鲁本·桑木旦桑盖和本地鲁土司结为供施关系，由汉、藏、蒙的施主们奉献财物，提供条件，扩建了静修院，从此嘎达寺初具规模。公元1771年11月份，嘉木样二世东行返回安多时途径嗄达寺，大师在该寺妙音文殊菩萨殿的右侧修筑卧室，曾长期修练妙音演说狮子功法，并赞扬说：“这个妙音演说狮子同五台山所塑的演说狮二者的神力无高低之分；南海普陀山的心性休息观世音像同这里的心性休息观世音二者，是只见一面就会关掉恶趣门而创开解脱之种的特异所依物”。并认定了胜乐的所依物和依地等的坛城所在地的胜乐修行岩洞，以及将来要出现天然慈尊弥勒佛的岩壁等。大师还给僧俗传授独雄大威德灌顶，并讲经传法，当时授予比丘戒的僧人有131人．在嘉木样二世座前剃度出家以及授予沙弥戒者则更多，在大师的大力倡导和亲自指教下，嗄达寺在讲修显密方面风气很浓。嘉木样二世回到拉卜楞寺后又派遣静修者甘加的转世化身到嗄达寺弘法，帮助该寺各方事务，彼师昼夜修习，从不间断，生活上艰苦朴素，从不向该寺提出任何方便自己的条件，佛学造诣深，因而大家很信崇他。

第三方面，华锐天堂寺的历任活佛寺主是东科尔，其第五世东科尔活佛阿旺索南嘉措（青海尖扎囊拉土管之后裔）是嘉木样二世的大伯父，嘉木样二世13岁时在东科尔活佛处受了沙弥戒。这样依亲眷关系的正常往来，承前启后，更加密切了拉卜楞寺与华锐各寺院的宗教、文化关系。就天堂寺而言，在寺规方面历代东科尔佛不但依据了西藏三大寺、青海塔尔寺，还根据拉卜楞寺的组织、设置等情况，严肃僧纲戒律，建立更加完善的显密双修制度，培养出了一批高僧大德，其中第六、十三世东尔科尔活佛就到拉卜楞寺闻思学院学了许多经典著作。罗桑琼湃、莫科一世活佛丹曲、莫科阿旺勒谢尼玛等去拉卜楞寺求学，并分别获多然巴·格西学位。罗桑琼湃精通大小五明，淹贯三藏，名扬藏区，可惜的是，这位大格西从拉卜楞寺学成归来的途中在黄河岸边不慎落水身亡，他给天堂寺建立联合五部经学院的弘法愿望未能实现。